Il n’y a pas de liaison directe au départ de la France. Il est possible, au départ de Paris, de prendre un vol de la compagnie Air Portugal à destination de Lisbonne, puis d’emprunter l’un des trois vols hebdomadaires qui relient Lisbonne à Bissao. Cet avion repart de Bissao le jour même.

Par ailleurs, la compagnie Royal Air Maroc assure deux vols hebdomadaires entre Casablanca et Bissao avec, à partir de la capitale économique marocaine, de multiples correspondances.

L’autre possibilité pour se rendre en Guinée-Bissao au départ de la France, consiste à gagner Dakar puis à prendre les vols de la compagnie Air Sénégal à destination de Bissao. Ces vols souvent complets sont assurés par des avions de faible capacité.

L’état du réseau routier est moyen, mais des travaux d’amélioration sont en cours. Il n’y a pas de transports publics à Bissao. Le mode de déplacement courant est le taxi individuel ou collectif. Il faut être prudent dans le choix du véhicule et du chauffeur. Il faut éviter de circuler la nuit.

Il n’y a pas de liaison aérienne officielle entre le continent et les îles de l’archipel des Bijagos. Il peut arriver que des avions privés se posent sur l’île de Bubaque. Il est possible d’utiliser la voie maritime au départ de Bissao, mais il est fortement déconseillé de partir en mer à bord de pirogues. Certains campements destinés à recevoir des touristes peuvent mettre à leur disposition des bateaux aux normes équipés pour la navigation en haute mer avec des équipages compétents.