La excavación en Dja’de el Mughara fue realizada por la primera expedición arqueológica francesa que trabajara en la campaña de rescate vinculada a la construcción de la represa de Tishrin sobre el Éufrates sirio.

Desde 1991, siete campañas de sondeos y excavaciones han revelado niveles arqueológicos que pertenecen, principalmente, al Neolítico acerámico (PPNB temprano, segunda mitad del IX milenio cal. aC).

En este sitio también se observan dos períodos más recientes: el Neolítico cerámico (período pre-Halaf, a comienzos del VI milenio aC) y la edad temprana de Bronce (III milenio aC).